Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc7bE9Q9Y3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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