Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Usp31E9Q6Y8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp31E9Q6Y8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp31E9Q6Y8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp31E9Q6Y8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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