Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FancfE9Q5Z5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FancfE9Q5Z5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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FancfE9Q5Z5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms