Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r56E9Q4U5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms