Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NebE9Q1W3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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