Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms