Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5cE9Q1F5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5cE9Q1F5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo5cE9Q1F5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo5cE9Q1F5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo5cE9Q1F5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo5cE9Q1F5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo5cE9Q1F5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo5cE9Q1F5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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