Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt78E9Q0F0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms