Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh10E9PXQ7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh10E9PXQ7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh10E9PXQ7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms