Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gcn1E9PVA8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gcn1E9PVA8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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