Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Nkx6-2D3Z4R4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nkx6-2D3Z4R4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nkx6-2D3Z4R4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Nkx6-2D3Z4R4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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