Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim12cD3Z3L3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms