Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc8D3YZV8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc8D3YZV8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms