Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ptprz1B9EKR1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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