Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nxpe3B9EKK6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms