Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol6B7ZC55 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol6B7ZC55 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms