Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Phf11cB4XVP9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Phf11cB4XVP9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Phf11cB4XVP9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Phf11cB4XVP9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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