Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms