Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cfap58B2RW38 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cfap58B2RW38 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms