Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud7bB2RUR8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms