Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apol7aB2RT54 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apol7aB2RT54 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms