Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035947B2RQY6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035947B2RQY6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035947B2RQY6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035947B2RQY6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035947B2RQY6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC035947B2RQY6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC035947B2RQY6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BC035947B2RQY6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms