Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NhsB1AV60 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NhsB1AV60 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms