Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trabd2bB1ATG9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trabd2bB1ATG9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trabd2bB1ATG9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trabd2bB1ATG9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trabd2bB1ATG9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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