Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Grik3B1AS29 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grik3B1AS29 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms