Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem238A9JSM3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms