Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H2-M5A7VMS3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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