Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3173A6NAS3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms