Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp4A4UUI3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms