Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms