Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Odf2A3KGV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Odf2A3KGV1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms