Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm6880A3KG45 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6880A3KG45 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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