Protein–RNA interactions for Protein: A2BIE1

Qser1, Glutamine and serine-rich 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qser1A2BIE1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Qser1A2BIE1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Qser1A2BIE1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Qser1A2BIE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Qser1A2BIE1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Qser1A2BIE1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Qser1A2BIE1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Qser1A2BIE1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Qser1A2BIE1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms