Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms