Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FocadA2AKG8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms