Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramel3A2AHA7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms