Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc163A2AGD7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc163A2AGD7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms