Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc173A0JLY1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms