Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NIF3L1Q9GZT8 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NIF3L1Q9GZT8 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NIF3L1Q9GZT8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NIF3L1Q9GZT8 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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NIF3L1Q9GZT8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NIF3L1Q9GZT8 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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NIF3L1Q9GZT8 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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NIF3L1Q9GZT8 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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NIF3L1Q9GZT8 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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NIF3L1Q9GZT8 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIF3L1Q9GZT8 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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NIF3L1Q9GZT8 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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NIF3L1Q9GZT8 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NIF3L1Q9GZT8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NIF3L1Q9GZT8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NIF3L1Q9GZT8 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NIF3L1Q9GZT8 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NIF3L1Q9GZT8 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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