Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRIM4Q9C037 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRIM4Q9C037 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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TRIM4Q9C037 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
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TRIM4Q9C037 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TRIM4Q9C037 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
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