Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C6Q969F1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C6Q969F1 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
GTF3C6Q969F1 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GTF3C6Q969F1 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms