Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SCN5AQ14524 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SCN5AQ14524 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SCN5AQ14524 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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