Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEUROD1Q13562 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NEUROD1Q13562 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEUROD1Q13562 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NEUROD1Q13562 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NEUROD1Q13562 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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