Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATRQ13535 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATRQ13535 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
ATRQ13535 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATRQ13535 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATRQ13535 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATRQ13535 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATRQ13535 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
ATRQ13535 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATRQ13535 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATRQ13535 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATRQ13535 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
ATRQ13535 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATRQ13535 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATRQ13535 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATRQ13535 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
ATRQ13535 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATRQ13535 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATRQ13535 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATRQ13535 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATRQ13535 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATRQ13535 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATRQ13535 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATRQ13535 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATRQ13535 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATRQ13535 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATRQ13535 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATRQ13535 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATRQ13535 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATRQ13535 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
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