Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FOXE3Q13461 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXE3Q13461 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXE3Q13461 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXE3Q13461 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXE3Q13461 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXE3Q13461 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXE3Q13461 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXE3Q13461 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
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FOXE3Q13461 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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FOXE3Q13461 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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FOXE3Q13461 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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FOXE3Q13461 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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FOXE3Q13461 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXE3Q13461 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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FOXE3Q13461 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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FOXE3Q13461 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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FOXE3Q13461 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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FOXE3Q13461 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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FOXE3Q13461 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
FOXE3Q13461 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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