Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTGDRQ13258 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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PTGDRQ13258 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTGDRQ13258 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTGDRQ13258 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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PTGDRQ13258 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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PTGDRQ13258 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTGDRQ13258 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTGDRQ13258 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTGDRQ13258 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTGDRQ13258 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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PTGDRQ13258 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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PTGDRQ13258 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTGDRQ13258 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTGDRQ13258 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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