Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CHAF1AQ13111 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CHAF1AQ13111 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.1 ms