Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CNTN1Q12860 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CNTN1Q12860 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CNTN1Q12860 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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