Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
TFF3Q07654 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-5.59□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
TFF3Q07654 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
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TFF3Q07654 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
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TFF3Q07654 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
TFF3Q07654 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
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TFF3Q07654 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
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TFF3Q07654 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
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TFF3Q07654 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-5.69□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-5.71□□□□□ -3.32
TFF3Q07654 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-5.72□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
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