Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
E2F1Q01094 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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E2F1Q01094 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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E2F1Q01094 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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E2F1Q01094 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
E2F1Q01094 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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E2F1Q01094 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
E2F1Q01094 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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